Após a guerra no Aoi Cosmos, a tripulação do Edens Zero lamenta a perda de Witch e faz uma importante mudança em seus planos. Antes de continuarem sua busca pela mãe, eles primeiro encontrarão e derrotarão Ziggy. Não há mais dúvidas de que Ziggy é um inimigo e uma ameaça ao universo. Mas antes de encontrar Ziggy, o Edens Zero encontra um curioso náufrago. É o capitão Connor, mas apenas Rebecca o reconhece e se lembra dele, e ele mesmo nega ser o capitão do Edens One?!