O box de Knights of Sidonia, escrito por Tsutomu Nihei, conta com os volumes 1 ao 8, além de um post-card e um marcador exclusivo da coleção e a caixa.
A saga inicia com o jovem Nagate Tanikaze, que cresceu no nível mais inferior da nave, que acaba sendo recrutado para ser um dos pilotos que protegem Sidonia.
Assim abrem-se as cortinas de uma nova batalha na qual Nagate terá de arriscar a sua vida pelo futuro da humanidade.