A jovem estudante Suzume tem o sonho de se tornar uma enfermeira, como sua falecida mãe. Morando com sua tia, ela se encontra com um misterioso jovem que parece estar procurando pelo que chamam de "uma porta" em algum lugar da cidade. Após dar direções ao homem, Suzume é alertada por suas amigas que o local que ele procura teve sua entrada proibida, pois pode ser muito perigoso. Neste momento, ela percebe ao olhar pela janela que um tipo de criatura gigante parece ter surgido sobre o local para o qual disse que o jovem deveria ir. A aventura de Suzume começa quando "a porta" abre um caminho inesperado para um mundo que as pessoas não estão cientes de que existe...